Ha na-achọpụta ọtụtụ 'njikwa dịpụrụ adịpụ' nke protein ndị enwere ike iji chọọ ọgwụ ndị ka mma

christina garridoANYA

Usoro ohuru ohuru nke otu ndi sayensi sitere na Centre for Genomic Regulation (CRG) na Barcelona achọpụtala ịdị adị nke ọtụtụ 'nchịkwa dịpụrụ adịpụ' nke na-achịkwa ọrụ nke protein na nke enwere ike iji dị ka ebumnuche iji nweta ọgwụ dị irè karị. ma na-arụ ọrụ nke ọma na ọrịa dị iche iche dị ka dementia, kansa na ọrịa na-efe efe.

'Njikwa anya' ndị a bụ nke sayensị mara dị ka saịtị allosteric. "Ndị a bụ njikwa dịpụrụ adịpụ nke dị anya site na ebe a na-arụ ọrụ nke protein, ma nwere ikike nhazi ma ọ bụ modulating," Júlia Domingo, onye mbụ na-ede akwụkwọ nke ọmụmụ ihe, nke e bipụtara na Wednesday a na magazin "Natura," kọwara. ABC Ọ gbakwụnyekwara ihe atụ, sị: “Ọ dị ka a ga-asị na ị na-eji ihe ndị a na-ahụ maka ime ime ahụ, ị ​​pụrụ ịgbanye ma gbanyụọ bọlbụ ahụ ma ọ bụ mee ka ìhè ahụ sikwuo ike.”

N'okwu a ebe ọ na-achọ igbochi ma ọ bụ mezie ọrụ nke ndị na-edozi ahụ na-ejigide ọrụ ha gbanwere na njide. Dịka ọmụmaatụ, n'ihe gbasara ọrịa cancer, protein ndị nwetara ngbanwe na-ahụ na ọrụ ha gbanwere, ha na-eme ya n'ụzọ na-adịghị mma na cell na-eto n'ụzọ dị ịtụnanya. N'ọtụtụ ọnọdụ, ọ dịghị ọgwụ ọ bụla nwere ike gbanwee ma ọ bụ gbochie ọrụ a na-adịghị mma ma ọ bụ, ọ bụrụ na ọ dị, ha akọwaghị ya ma na-ahapụkwa ya na protein ndị ọzọ na-arụ ọrụ nke ọma.

Na omenala, ndị dinta ọgwụ emebewo ọgwụgwọ na-elekwasị anya na saịtị protein na-arụ ọrụ, nke obere mpaghara ya na-emepụta mmeghachi omume kemịkalụ ebe ebumnuche jikọtara ya. Ihe ndọghachi azụ nke ọgwụ ndị a, nke a maara dị ka ọgwụ orthosteric, bụ na saịtị ndị na-arụ ọrụ nke ọtụtụ ndị na-edozi ahụ yiri nnọọ ma ọgwụ ndị ahụ ejirila ma gbochie ọtụtụ protein dị iche iche n'otu oge ahụ, ọbụna ndị na-arụ ọrụ nke ọma na-abaghị uru imetụ aka, nke nwere ike. na-akpata mmetụta ọjọọ.

N'ebe ahụ, ọ banyere n'echiche nke allostery na ikike o nwere maka ịmepụta ọgwụ. Ihe na-adọrọ mmasị banyere saịtị allosteric bụ na ha dị oke ọnụ maka protein ọ bụla. Ọ bụrụ na saịtị ndị a allosteric chọta akụkụ nke elu nke protein ebe ọgwụ nwere ike iru, ọ ga-abụ kpọmkwem kpọmkwem maka protein ahụ. Anyị nwere ike ịchọ ọgwụ ndị dị irè karị, "ka onye nyocha ahụ kwuru.

"Ọ bụghị nanị na anyị na-achọpụta na saịtị ndị a na-agwọ ọrịa dị ukwuu, ma e nwere ihe àmà na-egosi na a pụrụ iji ha mee ihe n'ọtụtụ ụzọ dị iche iche. Kama ịgbanwuo ma gbanyụọ ha, anyị nwere ike gbanwee ọrụ ha dị ka igwe okpomọkụ. Site n'echiche injinia, ọ dị ka à ga-asị na anyị akụrila ọla edo, n'ihi na ọ na-enye anyị ohere dị ukwuu iji chepụta 'ọgwụ ndị nwere ọgụgụ isi' na-aga maka ihe ọjọọ wee hapụ ihe ọma," André Faure, onye nyocha postdoctoral na CRG na-akọwa. na onye edemede mbụ nke edemede ahụ.

Onyonyo akụkụ atọ na-egosi protein mmadụ PSD95-PDZ3 site n'echiche dị iche iche. A na-egosi njikọ molekul na saịtị na-arụ ọrụ na edo edo. Acha anụnụ anụnụ ruo agba uhie na-egosi saịtị allosteric enwere ikeOnyonyo akụkụ atọ na-egosi protein mmadụ PSD95-PDZ3 site n'echiche dị iche iche. A na-egosi njikọ molekul na saịtị na-arụ ọrụ na edo edo. Ihe gradient si na-acha anụnụ anụnụ ruo na-acha uhie uhie na-egosi saịtị allosteric nwere ike ime - André Faure/ChimeraX

Maka nchọpụta a, ndị otu ahụ ejirila usoro nke na-enye ha ohere iwere protein na usoro usoro na nzute zuru ụwa ọnụ na saịtị niile. Iji mee nke a, ha ahọrọla protein abụọ bara ụba na proteome mmadụ anyị. “50% nke elu protein nwere ikike allosteric. Usoro anyị na-enye anyị ohere ịmepụta atlas nke saịtị allosteric, nke ga-eme ka usoro ịchọ ọgwụ ndị dị irè dịkwuo irè karị," Júlia Domingo na-ekwu.

Ndị na-amụ akwụkwọ ahụ mepụtara usoro a na-akpọ PCA abụọ-depth (ddPCA), nke ha kọwara dị ka "nnwale ike dị nro." "Anyị kpachaara anya na-akụrisị ihe n'ọtụtụ puku ụzọ dị iche iche iji mepụta nkọwa zuru ezu banyere otú ihe si arụ ọrụ," Prọfesọ nyocha ICREA Ben Lehner na-akọwa, onye nhazi mmemme CRG Systems Biology na onye dere ọmụmụ ihe ahụ. "Ọ dị ka ị na-eche na plọg ọkụ anaghị arụ ọrụ, ma kama ịlele nke ahụ, onye na-arụ ọrụ na-ebupụ ụgbọ ala ahụ dum wee nyochaa akụkụ niile n'otu n'otu. Site n'ịtụle puku ihe iri n'otu oge, anyị na-amata akụkụ niile dị mkpa n'ezie. "

Anyị na-eji algọridim ọgụgụ isi nke artificial iji kọwapụta nsonaazụ ụlọ nyocha.

Otu n'ime uru dị ukwuu nke usoro ahụ, na mgbakwunye na ime ka usoro dị mfe ịchọta saịtị allosteric, bụ na ọ bụ usoro dị ọnụ ala na ịnweta maka ụlọ nyocha ọ bụla n'ụwa. "Ọ na-achọ naanị ịnweta ihe ndị na-ahụ maka ihe ndị dị ndụ, ịnweta usoro DNA na kọmputa. Site na ihe atọ a, ụlọ nyocha ọ bụla n'ime ọnwa 2-3, yana obere mmefu ego, nwere ike ime nnwale a na protein nke mmasị ọ chọrọ, "ka Júlia Domingo na-ekwu. Olileanya ndị nyocha ahụ bụ na ndị ọkà mmụta sayensị anyị ga-eji usoro a mee ngwa ngwa na n'ụzọ zuru ezu maapụ saịtị allosteric nke protein mmadụ n'otu n'otu. "Ọ bụrụ na anyị nwere data zuru oke, ikekwe otu ụbọchị, anyị nwere ike ịga n'ihu otu nzọụkwụ ma buru amụma ihe niile site na usoro nke protein ruo na ọrụ ha. Jiri data ndị a na-eduzi ha dị ka ọgwụgwọ ka mma iji buru amụma ma ọ bụrụ na mgbanwe ụfọdụ na protein ga-adaba na ọrịa," onye nyocha ahụ kwubiri.